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Tout ce qu’il faut savoir sur les tests de microbiote

Doctorante en Pharmacie

Un microbiote intestinal équilibré est essentiel à la bonne santé. De plus en plus de laboratoires proposent des tests afin de l’analyser. Quel est leur intérêt ? Sont-ils fiables ? 

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Une équipe éditoriale spécialisée en nutrition. Auteurs du livre Les aliments bénéfiques (Mango Editions) et du podcast Révolutions Alimentaires.

Notre microbiote intestinal, aussi nommé flore intestinale, représente jusqu’à 100 000 milliards de micro-organismes vivants qui vivent au sein du tube digestif, plus précisément dans l’intestin grêle et le côlon.

On y retrouve des champignons, des bactéries et des levures qui ne sont pas pathogènes et qui vivent en symbiose avec le reste de notre organisme, chacun profitant des bienfaits de l’autre. 

La flore intestinale est essentielle et joue de multiples rôles dans l’organisme

  • dans la digestion, en permettant la bonne assimilation et métabolisation des nutriments de l’alimentation ;
  • pour la synthèse de certaines vitamines du groupe B, de la vitamine K et de trois des acides aminés (valine, leucine, isoleucine) ;
  • pour la protection contre les pathogènes en jouant un rôle de barrière, et en informant le système immunitaire des différences entre les micro-organismes commensaux de ceux pathogènes ;
  • dans la régulation de certaines voies métaboliques (acides gras, magnésium). 

Le microbiote intestinal est au cœur de recherches concernant son lien avec les maladies. Dans le cadre de maladies inflammatoires chroniques de l’intestin, un déséquilibre de la flore a été observé et pourrait être à la fois une cause et conséquence de la maladie. 

Il aurait potentiellement un rôle dans les maladies métaboliques, l’obésité, l’apparition de cancer, les maladies neuro-dégénératives, les troubles psychiatriques, et les risques cardiovasculaires. 

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Quel est le but des tests de microbiote ? 

Au vu de l’intérêt du microbiote sur la santé, de nombreux laboratoires ont lancé des kits donnant la possibilité d’analyser sa flore. 

Le but des tests du microbiote est d’analyser la composition de la flore intestinale qui est représentée par plus de 1000 espèces différentes.

Cela permet de faire un état des lieux complet afin de relever les potentiels déséquilibres (microbiote appauvri ou enrichi) à l’origine de désagréments et de maladies.

Les résultats de cette analyse permettent au laboratoire de fournir des conseils personnalisés alimentaires pour rééquilibrer ce microbiote. 

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Le microbiote intestinal est au coeur de nombreuses recherches

Comment fonctionnent les tests du microbiote ? 

Les laboratoires utilisent un échantillon de selles qu’ils analysent grâce à des technologies de séquençage ADN permettant d’obtenir la composition de la flore intestinale.

Les quantités respectives des différentes espèces bactériennes sont également éclairées.

Comment se déroulent les tests en pratique ? 

Pour pratiquer ces tests, il faut acheter un kit sur les sites des marques ou au sein même de certains laboratoires. 

Une fois le kit reçu, vous pouvez réaliser un prélèvement de selles grâce aux outils fournis. 

Il faut ensuite renvoyer par voie postale (ou directement dans un laboratoire partenaire) une enveloppe contenant votre prélèvement.  

Quelques semaines plus tard, vous recevez les résultats d’analyse des populations bactériennes qui peuplent votre flore intestinale ainsi que l’analyse moyenne de la population de référence.

Avec ce rapport, des conseils personnalisés sont fournis pour rééquilibrer au mieux ce microbiote. 

Certaines marques donnent la possibilité de consulter un praticien partenaire pour expliquer ces résultats d’analyse. 

Combien ça coûte ?

Les analyses du microbiote ne sont pas encore reconnues et ne peuvent donc pas être prescrites par un professionnel de santé ni remboursées

Les prix sont variables en fonction des prestations. Elles commencent aux environs de 100 euros mais la majorité des tests peuvent être achetés dans une fourchette de 250 à 300 euros. 

Qui peut faire un test de microbiote ? 

Les personnes ayant des symptômes au niveau intestinal, voire des maladies, ainsi que toute personne curieuse de l’état de santé de son microbiote peut décider d’entreprendre ces tests. 

Ont-ils une véritable utilité ? 

Des études ont montré que le microbiote intestinal pourrait servir de marqueur de diagnostic, de pronostic et thérapeutique concernant un nombre étendu de pathologies et désagréments intestinaux. 

Néanmoins, il nécessite de réaliser des études de plus grande ampleur pour valider cet intérêt d’analyse de la flore intestinale. 

Les tests vendus actuellement ne peuvent donc actuellement pas prétendre à l’aide au diagnostic ou à la recherche de la meilleure thérapeutique. 

Cependant, le futur de l’utilisation du microbiote en tant que biomarqueur semble prometteur. 

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